精子畸形率99%可以考虑做试管婴儿。
试管婴儿是指把精子和卵子提取出来，用特殊的方法将其在体外结合形成受精卵，然后植入女方子宫内，为夫妻双方提供生育健康孩子的机会。试管婴儿的成功率较高，可以达到40%~60%，但是需要多种条件才能够成功，健康有活力的精子是一个重要前提。一般来说，部分精子畸形也可以怀孕成功。但是，如果精子畸形率超过96%，就属于畸形精子症，通过自然受孕的概率大幅下降，也可以通过辅助生殖技术比如试管婴儿实现怀孕目的。
试管婴儿技术对于精子畸形率99%的患者，可以对精液进行实验室处理，通过离心、梯度离心的方式，或者采取胞浆内形态学筛选精子注射技术进行精子筛选，优选成熟的、具有受精潜能活动的优质精子进行受孕，从而可提高受精率、着床率和妊娠率以及降低流产率。
二、精子畸形率99%可以做试管婴儿吗通常情况下，精子畸形率99%可以做试管婴儿，具体内容如下：
中度及严重的少、弱、畸形精子症都是可以行试管婴儿治疗的。根据严重情况的不同，治疗的效果是有差异的。质量越差的精子，与卵子形成优质胚胎的几率就低，成功率也就下降。所以在进入试管婴儿治疗前，先对男性导致畸精的病因进行针对性治疗是应该的。但无论如何，只要有活的精子，就有妊娠的可能，都应积极试管婴儿治疗，不应放弃。对于严重畸形精子症，建议患者早发现、早治疗，平时要戒烟酒，避免熬夜，规律生活，调整生化状态，适量吃一些高蛋白的食物，如牛奶、鸡蛋等。
三、精子畸形能做试管婴儿吗随着医疗技术的发达，不易生育而有想要生育的女性是可以选择去做试管婴儿的。试管婴儿要求的女性着床环境以及男性精子质量都应当是良好的，如果男性的精子存在畸形的话是需要接受治疗的，那么，精子畸形能做试管婴儿吗？
畸形精子是可以做试管婴儿的，试管婴儿本身各方面要求就高，医院会找出质量最高的那个进行试管婴儿培育的，不会所有都是畸形，可以放心到医院去做，不合格的精子也不会取的。
畸形精子不一定会导致胎儿畸形，因为女性生殖道有优胜劣汰的功能，当精子穿过女性生殖道的过程中，大部分畸形精子会被淘汰掉，从而保证最后与卵子“会师”的精子的质量。
胎儿畸形的原因有：
母体或环境因素
放射线早孕期胎儿吸收的放射线剂量超过5rad时，胎儿畸形的风险会明显增加;
化学剂某些药物可导致胎儿畸形，尤其是在早孕期使用时，因此妊娠期用药应在医生指导下合理用药。农村妇女妊娠期应避免接触农药。长期大量饮酒可导致胎儿酒精综合征，表现为小头畸形、智力低下和特殊面容。重金属(汞、铅等)增加胎儿畸形的风险。
感染孕期母亲感染某些微生物可导致胎儿感染并导致胎儿畸形，如风疹、巨细胞、单纯疱疹、弓形虫、梅毒等。
早孕期高热。
孕期高血糖糖尿病孕妇早孕期血糖控制差，可增加胎儿畸形的风险，主要是先天性心脏病、神经管畸形、唇腭裂等。
饮食因素食物中叶酸缺乏增加胎儿神经管缺陷和唇腭裂的风险。
遗传因素
是指来自父母亲的遗传物质的异常而造成畸形。如：父母染色体异常、父母携带突变基因等。有时是受精卵自身发生了染色体分离异常或基因突变。近亲结婚时，由于夫妻双方携带相同异常基因的风险增加，导致某些隐性遗传病的发病率显著增加，因此近亲不宜结婚或生育。
健康饮食能提高精子质量
精子生长需要营养物质供给。有些男子饮食单调，偏食、挑食，不喜欢吃动物性食物，天长日久，可使体内含锌量下降。微量元素锌被誉为“夫妻和谐素”，男子缺锌，会使性欲及性功能减退，精子数目下降30%～40%，甚至使人丧失生育能力。
鸡肉、鸡蛋、鸡肝、花生克、猪肉都是含锌较高的食物。在吃这些食物时，注意不要过量饮酒，以免影响锌的吸收。另外，食物中含赖氨酸高是精子形成的必要成分。鳝鱼、鱿鱼、泥鳅、鳗鱼、海参、带鱼、墨鱼、以及山药、豆腐皮等食物都含有赖氨酸高。
然而，有些不法商贩用甲醛水溶液泡海鲜，如鱿鱼、墨鱼、海参等，泡在溶液里外观完整色泽光亮，消费者误以为是高鲜度的海鲜品。因此，吃此类海鲜一定要谨慎，否则就适得其反。
而为了精子的质量，咸鱼、肉类加工品（如香肠、火腿）、腌制蔬菜要少吃。这些食物中可能含有亚硝胺类化合物，这是强致癌物。
避免烟、酒等影响精子质量
烟和酒是精子的大敌。有些男性的身体对香烟中的毒素相当敏感，香烟中的尼古丁能杀伤精子。匈牙利一位医学博士声称：吸烟者精液中所含精子数目比不吸者少，而且畸形精子的数较多。长期大量吸烟是导致不育的重要因素之一。而酗酒则可能会导致男性生殖腺功能降低，使精子中染色体异常，从而导致胎儿畸形或发育不良。
四、精子畸形率高能做试管婴儿吗有些男性在检查时，发现自己精子畸形率很高，一般来说，正常形态的精子少于4%为畸形精子症。精子畸形是男性不育的原因之很多男性就想通过试管婴儿来帮助自己。但是，精子畸形率高能做试管婴儿吗？
精子畸形率高能做试管婴儿吗
畸形精子是可以做试管婴儿的，试管婴儿本身各方面要求就高，医院会找出质量最高的那个进行试管婴儿培育的，不会所有都是畸形，可以放心到医院去做，不合格的精子也不会取的。
畸形精子症是如何引起的
长期熬夜、吸烟、酗酒等不良生活习惯，或长期在高温、有毒物及放射线的环境中工作，或伴有附睾炎、睾丸炎或精囊炎等生殖腺体感染、或伴有精索静脉曲张等因素均有可能会引起畸形精子症。
有研究发现，单纯精子畸形率升高并不会导致胎儿畸形率升高，胎儿畸形发生率最高的时期是在女性怀孕的头三个月内。在此期间，如果孕妇服用有危害性的药物、接触到有毒有害的环境、或感染某些病原体如病毒等，将会直接危害到胎儿器官的发育，从而导致胎儿畸形或发育迟滞。如此说来，即使精子畸形率过高，胎儿也不一定就会畸形。但有小部分畸形精子症患者同时存在精子DNA碎片率高、染色体异常等疾病，可能会造成流产率和胎儿畸形率升高，应注意及时筛查。
精子畸形率高怎么办
改善畸形精子症的关键在于首先应该纠正其不良生活习惯如熬夜、吸烟等；其次应改善或避免有害的工作环境如高温、有毒及放射线暴露等；再者，应加强抗氧化治疗包括大剂量应用VitC、VitE，补充微量元素如锌、硒等；最后，应积极治疗原发疾病如生殖腺体感染、精索静脉曲张等。即使有部分畸形精子症患者通过上述治疗也很难降低精子畸形率和自然生育时，辅助生殖技术也可助力患者达成生育一健康宝宝的心愿。